在这前后，日军还在上新河一带残杀中国被俘军人及难民28730人。到处尸骸遍野，人血染地，南京成了一座血腥的人间地狱。
日本《东京日日新闻》从军记者铃木二郎记述道：“我随同攻陷南京的日军一道进城，在城内待了四天，目击日军无数惨绝人寰的行为。”“十二月十三日，在中山门附近城墙见到极其恐怖凄惨的大屠杀。
俘虏们在二十五公尺宽的城墙上排成一列，许多日本兵端着插上刺刀的步枪，齐声大吼，冲向俘虏们的前胸或腹部刺去。一个接着一个被刺落到城外去了。
只见飞溅的血雨喷向半空，阴森的气氛使人汗毛直竖，我站在那里，吓得目瞪口呆，不知所措。可是，俘虏们有人脸上浮泛着冷笑，有人若无其事的大笑，等待着死亡。”
据当时《朝日新闻》从军记者今井正刚说：“我于十二月十五日夜间，在大方巷《朝日新闻》办事处前面马路上，看到数千人头攒动，一望无际的中国人群，被赶赴下关屠场。
在天色微明的扬子江畔，一片黑黝黝的尸体堆垒如山，在尸山里蠕动着人影，总有五十人乃至一百人以上，他们在日军刺刀的*迫下转来转去拖曳着尸体，丢向江流里去。作业完毕，苦力们被排列在长江岸边，哒！哒！哒！一阵机关枪声，只见仰面朝天、翻身仆地、腾空跃起，一一都跌落江中，被滚滚波涛卷走。”据在场作业的一个日本军官说：“这里被杀害的中国人大约是两万人。”
南京市崇善堂在难民区内组织了“崇字掩埋队”，下设4个分队，从本月起，南自中华门、通济门外，西自水西门外，东自中山门外，城内自城南经鼓楼至挹江门以东，共收尸112266具。
世界红十字会南京分会从12月22日开始收埋尸体，第一天在清凉山埋葬尸体129具，在中华门外望江矶等处埋葬尸体650具。12月28日，一次收殓6468具，埋葬在中华门外普德寺，后来逐渐增加到9721具。他们的工作陆续做到第二年夏天还没有完结，到10月底，才把数字作一总结，共埋葬男女尸体43071具。
中国红十字会掩埋尸体22300余具。
此外，日军也处理了大量尸体。据日本南京碇泊场司令部少佐太田寿男交待，该司令部于下关地区“处理掉”尸体10万具，为此动用的船只有30只，卡车10部、负责搬运尸体的士兵800人。
据不完全统计，日军在南京大屠杀中，杀害的中国人竟达30万以上！这是人类历史上前所未有的屠杀记录。
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