他坐镇拉萨，建立雪域地方政权。这个新政权的各级官员，都是为大汗和格鲁派领袖尽忠尽力的蒙古族、藏族的有功人士。把这些人封为贵族，赐给庄园和农奴。
他命令索南饶丹，对以往雪域的法律作了改革。制定十三法，并逐条解释说明。进一步从法律上巩固和硕特蒙古贵族与格鲁派的既得利益。
他还对雪域地方政权作了局部调整，在保留元代以来雪域地方政权设置的十三种官职基础上，又新增设了噶（行政官员）、化本（武职官员）等职官，健全了雪域地方政权的行政机构。
为了巩固后方，他把青海辖境分为左、右两翼。自西宁西边的东科尔起，沿今湟水上游、青海湖、布哈河、布隆吉河迄额济纳河为界的东部和北部为左翼；西部和南部为右翼。分别由他的10个儿子率部驻牧，成为和硕特的根据地。规定青海当地和川西部落的赋税，全部归青海的硕特部支用。又让自己的大侄子鄂齐尔图汗担任卫拉特蒙古盟主，镇守青海。
他牢牢控制着军队的指挥权，将亲信部队，驻扎在拉萨北面的当雄一带，由大汗直接统辖，称为“当雄八旗”。
人家功绩这么大，称个汗还不应该？
??
听吕大器讲了固始汗的事迹，朱亨嘉眉头深锁。
叹了口气：“此人不好对付呀！”
吕大器忙安慰道：“监国不必过于担忧，此人有个弱点，并非成吉思汗的直系后裔，难以有效号令全蒙古”。
朱亨嘉没好气道：“不可大意，孤也不是太祖直系子孙，不也照样打下了偌大的江山？”
吕大器急忙闭嘴，暗悔自己说错了话。
“先生可知这卫拉特蒙古有多少部落，内部团结吗？”
“监国，卫拉特蒙古，吾大明称之为瓦剌。分为四大部：和硕特、准噶尔（绰罗斯）、杜尔伯特、土尔扈特，另有辉特等许多小部。固始汗所在的和硕特部，世代为卫拉特蒙古盟主。固始汗此人，惯于笼络人心，在卫拉特蒙古中威望很高，准噶尔、杜尔伯特、土尔扈特诸部皆愿听其调遣”。
内部团结，无懈可击。
“先生可知现在的固始汗，控制的疆域有多广？兵马有多少？”
“固始汗不仅控制了青海和雪域，还控制了哈密、甘肃、哈萨克的广大地区。臣估计，其和硕特部本部骑兵不少于十万，再征召其他卫拉特部落和雪域的藏兵的话，总兵力不会少于三十万”。
实力雄厚，当缓图之。
“诸臣劝孤和嘉绒人重开茶马市，先生以为何如？”
“此是利国利民的大好事，宜速施行。只是，臣觉得，不应仅和嘉绒人贸易，藏地的其他势力，包括这固始汗，也可以许其茶马互市”。
朱亨嘉一楞：“这固始汗不是归顺了满清吗？先生怎么劝孤许其互市，助纣为虐？”
吕大器不慌不忙：“崇祯八年，固始汗遣使至盛京，向清虏贡马匹、方物，归顺了清虏。这其实有不得已的地方。彼时，沙俄在西北屡次侵略卫拉特蒙古；东方的喀尔喀蒙古与卫拉特蒙古也经常冲突，崇祯九年，喀尔喀蒙古的却图汗派兵攻打他。所以他使用远交近攻之策，联合清虏，先灭青海的却图汗，再灭康区的白利土司，最后消灭雪域的藏巴汗。此人雄才伟略，又怎肯真心屈于清虏之下？降清，不过是其政治手段耳”。
朱亨嘉恍然大悟。
自己还是太狭隘啊！听人说这固始汗向清虏称了臣，就以为他对清虏忠心耿耿。部落和部落之间，打来打去、降来降去的，不过是政治需要而已。哪有什么忠心可言？
若方法得当，未必不能让这固始汗重新归明。
“吕先生，孤欲重建乌斯藏都司、朵甘都司、俄力克军民元帅府，并重开茶马市。办这些事前，需遣一精通雪域事务的大臣前往雪域，联络各方势力、笼络人心。先生可愿替孤走一趟?”
安抚雪域？那吾岂不是成了张骞、班定远那样的人物，青史留名了？
吕大器激动万分，大声答道：“臣愿往”。
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