距离石英大会开幕时间已经不远了，小智等人也终于出发前往了石英高原，此时他们正在一个山谷中休息，小霞在谷中河流旁垂钓，小智和测试培育情况的小刚在做友情切磋。
“皮卡丘，十万伏特。”
“六尾，喷射火焰。”
电流与火焰交融顿时发生了爆炸，烟雾过后，山壁居然裂开来，出现了一个好像神坛的遗址，上面还有一个青铜钟。
“啊咧？！这是什么？”小霞好奇地看着神坛和青铜钟，转头看向小智和小刚问道，“小智、小刚，你们认识吗？”
“嗯…看上去好像某种遗迹哎…”小刚说着清理了下神龛，结果在上面看到了一个黄色的有些神秘花纹的物品。
“咦！这个是什么？”小智看着那个物品，只感觉怪怪的。
“哇，好漂亮喔！”小霞似乎很喜欢这个物品。
这时突然有个人把这个物品拿走开始观察起来，小智等人一惊，回头一看似乎在哪里看过这个人。
“这个…不会错了…”只见那个拿走物品的女子一边看一边说着让人不懂的话。
“您好，请问您是怀特博士吗？”小智这会儿想起了这人的身份。
“咦？！你认识我？”怀特博士没想到会被人认出身份。
“嗯，我们之前有看过您之前有关超古代文明的讲座视频。”小霞这会儿也认出了怀特博士，给她解释道。
“原来如此，不过有话等下再说，”怀特博士说着转身对着后面过来的人大喊，“团长，发现金色之眼了。”
后面过来的团长看着手中的金色之眼，也开心的说道，“终于发现了吗？你干得很好。”
“你好，我是第一个发现的人，我叫小刚，今天黄道吉日，事业有成…”小刚又一次上前搭讪了，结果双手被怀特博士抓住使劲地摇着。
“太感谢你了，我叫怀特，请多多指教，”怀特博士说着又转身笑着对着团长道，“可是没想到这么快就发现到了，我有点不敢相信…”
看着前面痴痴地望着怀特博士的小刚，小智他们就知道小刚的老毛病又犯了，小智也不管他径直走上前道，“您好，我是来自真新镇的小智，这两位是我的同伴小刚和小霞，虽然我们对发现的宝物不感兴趣，但可不可以告诉我们这里的一点信息呢？”
“当然没问题，请跟我来吧。”说着怀特博士就带着小智、小霞还有痴痴望着她的小刚来到了帐篷里。
怀特博士和小智他们说明，这附近有超古代文明的遗迹，而小智他们发现的也是其中之一，后来团长他们又找到了和那个金色之眼一样花纹的汤匙。
在怀特博士摇动了那个汤匙的时候，小智和皮卡丘都感到了一种奇怪的感觉。
之后怀特博士又拿出一块超古代的石板，给众人翻译了上面的意思，只是听着听着，小智就感觉不大对劲了。
“毁灭世界的两股力量和平息一切的力量…”小智喃喃着，突然抬头问道，“怀特博士，你们有没有想过，如果你们在这么挖掘下去，如果触发这两股毁灭世界的力量却没有找到平息一切的力量，世界毁灭了可怎么办？”
“这…”怀特博士显然没有想过这个问题，她只是喜欢超古代的文明，想要进行研究超古代神奇宝贝文明消失的原因而已。
“小智你会不会太杞人忧天了？”小霞觉得只是挖掘遗迹应该不会发生这种事。
“是啊，是不是你太多心了？”小刚也觉得不太可能。
“希望如此吧。”见此小智也只能叹了口气。
白天无事发生，小智以为自己真的多心了，也就和怀特博士他们一起在帐篷里休息了。
不过第二天他们起床后，发现遗迹有被人动过的痕迹，在神龛前他们还发现了一串大脚印和一个黑色的哑铃。
团长上去拿起黑色哑铃道，“博士，这个是不是代表黑色黑暗的东西呢？”
可是他刚说完，身体被红光包裹，吸进了黑色哑铃里，那个黑色哑铃飘浮起来，中间的圆球露出了熟悉的身影，是火箭队三人组。
见此小智眼中蓝光一闪，一层蓝色的防护罩护住所有人，那个黑色哑铃发出红光，被小智的波导防护罩挡住，但也推的小智后退了好几步，小智立刻大喊道，“大家快离开！”只是脚步有点慢的几个考古队成员还是被红光定住吸入了黑色哑铃里面。
可是小智没想到的是，怀特博士带着众人刚躲到车里，之前的金色之眼也发出黄光，在和那个汤匙结合后发出黄光将几人打飞出车子，而那个金色之眼也飞了出生。
慢慢的金色之眼变成了一只巨大的胡地，而黑色哑铃慢慢的变成了一只巨大的耿鬼，两只神奇宝贝身上都有些诡异的花纹，而小智却没有感受到它们的波导。
两只巨大的神奇宝贝见面就开始了攻击，见此小智赶紧撑开波导防护罩，避免几人被攻击的余波给误伤到，小智转头问怀特，“现在这个两个应该是那个石板所说的两股毁灭世界的力量，那个平息一切的力量到底是什么？又该怎么触发？”
“我…我也不知道，我只是感兴趣…”怀特博士也束手无策，说着她眼里都快急出眼泪来了。
“怀特，你只是要达成自己的梦想而已。”小刚开口安慰道。
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